تطبق المؤسسة الإقليمية لمقاصة وتسوية المدفوعات العربية، المالكة والمشغلة لمنصة بٌنى للمدفوعات العربية، المبادئ الرئيسية التالية التي تشكل الإطار التوجيهي للحوكمة على مستوى المؤسسة:
لدى المؤسسة الإقليمية لمقاصة وتسوية المدفوعات العربية إطار وثيق وواضح للحوكمة، يتضمن مجلس الإدارة، اللجان الإدارية، اللجنة التنفيذية، والمجموعة الاستشارية.
تتحمل هذه الهيئة التمثيلية للمساهمين المسؤولية الكاملة لإدارة المؤسسة وتوجيه أعمالها. يضع مجلس الإدارة السياسات والقواعد واللوائح التنظيمية المتعلقة بالأمور الإدارية والمالية والموارد البشرية، بما في ذلك تعيين أعضاء اللجنة التنفيذية وتحديد مكافآتهم، ولها كامل الصلاحيات لإدارة المؤسسة الإقليمية لمقاصة وتسوية المدفوعات.
يفوض مجلس الإدارة اللجان التابعة له بعض سلطاته وصلاحياته ومهامه لفترة معينة، وفقًا للشروط والأحكام المحددة المنصوص عليها في المواثيق المعتمدة من قبل مجلس الإدارة.
قام مجلس الإدارة، بموجب القرارات المتخذة، بتشكيل ثلاث لجان تابعة لمجلس الإدارة:
بقيادة الرئيس التنفيذي هو المسؤول عن وضع وإدارة وتنفيذ استراتيجيات المؤسسة الإقليمية لمقاصة وتسوية المدفوعات.
مجموعة المستخدمين الإستشارية هي هيئة إستشارية تساعد اللجنة التنفيذية على التكيف مع التغييرات التنظيمية واتجاهات السوق الجديدة ومواكبة أي تحديثات في مبادئ البنية التحتية المالية والمعايير الدولية الأخرى الجائز تطبيقها على أعمال المؤسسة الإقليمية لمقاصة وتسوية المدفوعات.
تتكون مجموعة المستخدمين الاستشارية من 4 مجموعات فرعية تركز على جوانب محددة من المجالات المختلفة أعمال المؤسسة الإقليمية لمقاصة وتسوية المدفوعات وهي: